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苹果手机的短信清空后是否出现感叹号，取决于具体的清空方式和短信的状态。
如果短信未被完全删除或移动到了某个特定的文件夹里，可能仍然会显示感叹号，感叹号通常表示这条短信有未读或未处理的状态，如果短信已经被彻底删除，那么通常不会再次出现感叹号。
如果设备出现了系统错误或者配置问题，也可能导致清空短信后仍然显示感叹号，如果遇到这种情况，可以尝试重启设备，或者检查相关的设置和应用程序状态。
如果清空短信后仍然看到感叹号，建议检查短信是否真的被删除，或者考虑设备系统是否出现了某种问题，如果无法确定原因，可以联系苹果官方客服寻求帮助。